Atualmente, estou tentando resolver um problema semelhante.
Alguns anos atrás, usamos o Veritas Backup Exec 9 para backups de máquinas clientes, mas decidimos seguir a rota de pedir que os clientes armazenassem seus dados nos servidores de arquivos e não em suas máquinas. Como pode ser visto nas respostas anteriores a esta pergunta, esta parece ser uma escolha popular.
Depois de usar essa configuração por alguns anos, decidimos voltar aos backups da máquina cliente. No momento, estamos procurando um produto que ofereça proteção contínua, já que achei esses tipos de backup mais fáceis de gerenciar, pois qualquer problema é encontrado rapidamente. Existem questões óbvias de largura de banda a serem consideradas, mas em nossa situação isso não é um problema.
O motivo pelo qual acredito que os backups são mais eficazes do que solicitar que os usuários armazenem seus dados nos servidores de arquivos é que eu descobri que os usuários invariavelmente encontram uma maneira de armazenar alguns dados importantes em sua máquina local.
Existem muitos aplicativos de backup por aí e meu conselho seria escolher um que corresponda ao seu orçamento, atualmente estou olhando para os produtos em barracudaware.com. Eu, pessoalmente, aconselho não fazer backup de máquinas clientes.