Eu já vi isso antes.
A reinicialização de named irá liberar os dados atualizados dos arquivos .jnl de volta para o arquivo de zona, mas também há outra maneira.
rndc freeze <zone> , mas isso desativará o DDNS, portanto, ele deve ser seguido por um
rndc thaw <zone> para reativá-lo e deve limpar os arquivos .jnl .
Há aparentemente um rndc sync no Bind 9.9.