Provavelmente, você fornece os dados errados no processo de geração de CSR. O FQDN do domínio que você deseja proteger precisa ser preenchido no campo CN .
Assumindo que você use linux e openssl e o domínio para o qual você deseja obter um certificado SSL é "www.mycooldomain.com" (SSL-Cert com www.):
$ openssl req -new -nodes -keyout mycooldomain_com.key -out mycooldomain_com.csr -newkey rsa:2048
Em seguida, você digita e precisa preencher os campos obrigatórios:
Generating a 2048 bit RSA private key
....++++.....
writing new private key to 'mycooldomain_com.key'
-----
You are about to be asked to enter information that will be incorporated
into your certificate request.
What you are about to enter is what is called a Distinguished Name or a DN.
There are quite a few fields but you can leave some blank
For some fields there will be a default value,
If you enter '.', the field will be left blank.
-----
Country Name (2 letter code) [AU]:CH
State or Province Name (full name) [Some-State]:Bern
Locality Name (eg, city) []:Bern
Organization Name (eg, company) [Internet Widgits Pty Ltd]:Your Name / Company
Organizational Unit Name (eg, section) []:
Common Name (eg, YOUR name) []:www.mycooldomain.com
Email Address []:[email protected]
Please enter the following 'extra' attributes
to be sent with your certificate request
A challenge password []:
An optional company name []:
O país para mim é CH, meu estado é Berna, City Bern também, o nome de Você ou sua Empresa, Seção está vazia para mim e então como Nome Comum, o FQDN você quer proteger.