O sistema operacional é irrelevante aqui, pois ele precisará ser feito na inicialização ou fora dele, se você estiver falando sobre como formatar o disco rígido principal.
Eu recomendaria Darik's Boot e Nuke e usá-lo em uma unidade USB, basta colocá-lo em uma máquina e iniciar, depois mover para o próximo.
Alternativamente, se você não se importar com um pouco de configuração e essas máquinas estiverem em rede, você pode olhar para a implantação do Boot e do Nuke em um servidor PXE e usar TFTPD32 no Windows ou em qualquer servidor PXE no Linux, você poderá lançar Dban pela rede - basta cuidado para que isso seja separado ou outras máquinas não consigam arrancar a partir dele!