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Sorta. Você pode instalar o Hyper-V Server 2012 no SD. Você não pode instalar o Server 2012 com Hyper-V em um SD, no entanto. Esses são dois produtos diferentes com nomes infelizmente semelhantes.
O Hyper-V Server 2008 R2 (2.0) também pode ser inicializado a partir de um cartão SD.
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Existem instruções especiais para fazer isso, você não pode simplesmente executar a configuração como você está tentando.
A Microsoft forneceu instruções Implantando o Microsoft Hyper-V Server 2008 R2 em Flash USB Drive , que funcionam tanto para o 2008 R2 quanto para o 2012.
Nota lateral: O cartão SD deve aparecer como um dispositivo de disco USB, isso depende do controlador SD. Nos servidores HP e Dell que eu vi, este é o caso. Eu só vi o contrário em hardware embarcado.