Não é bom que esse diretório dentro de seu diretório pessoal seja de propriedade de root.
Você pode executar algum script de configuração, etc. como root?
De qualquer forma, por favor execute:
sudo chown -R scaffrey:scaffrey /home/scaffrey/.config/sublime-text-3/
Isso deve devolver a propriedade de todos os arquivos e diretórios abaixo e incluir esse de volta ao seu usuário.
E, por favor, não esqueça: Nunca mexa em programas gráficos normais com sudo
. Pelo menos use gksudo
, se for realmente necessário, mas tente evitá-lo mesmo assim!