O projeto FreeRDP também está trabalhando para implementar os recursos remoteapp do rdp 6/7.
O SeamlessRDP funciona bem o suficiente agora para usar dessa maneira, mas não está realmente utilizando o recurso remoteapp da Microsoft no Windows Server 2008
Eu também gostei de usar o aplicativo chamado Remmina. Embora eles não tenham suporte para o RemoteApp, eles o farão quando o FreeRDP estiver pronto. Remmina também faz algumas outras coisas legais, como mapear o seu diretório Home linux para o Windows para que você possa salvar arquivos lá com o aplicativo do Windows. O mesmo vale para a impressora Linux padrão ... onde o aplicativo do Windows pode imprimir em qualquer impressora que o sistema Linux tenha instalado.