Eu acredito que este é um lado do cliente, e não erro do lado do servidor, com base em seus comentários parece que você está usando svn baseado em arquivo, então o único banco de dados que pode ser bloqueado é no cliente.
Tente isso
$ cd /my/repository/.svn
$ mv wc.db wc.db.old
$ sqlite3 wc.db.old
sqlite> .backup main wc.db
sqlite> .exit
agora você tem um novo wc.db que não deve ter nenhum erro de bloqueio
Se tudo der certo, exclua wc.db.old
Se você não pode sempre
$ mv wc.db.old wc.db
e você estará de volta onde você afirmou antes que eu postou isso .....
mas deve funcionar ....