A sintaxe correta pode ser encontrada no IIS.NET site .
Para alterar o tamanho da fila, você teria que inserir:
appcmd.exe set APPPOOL "DefaultAppPool" /add.queueLength:10000
no seu caso:
appcmd.exe set APPPOOL "MSExchangeServicesAppPool" /add.queueLength:10000
Você pode listar as configurações atuais com:
appcmd.exe list APPPOOL "MSExchangeServicesAppPool" /text:*
Espero que isso ajude.