Você está certo de que a máquina dual-proc tem 6 canais de memória, 3 por processador. Essa arquitetura em particular é chamada de NUMA e é muito bem projetada no sistema do qual você está falando - tentará para manter a memória de um thread "perto" do núcleo que está sendo executado e será um pouco mais lenta se tiver que usar memória vinculada aos canais de memória do outro processador, mas eu não me preocuparia com isso, cada caixa que eu uso atualmente tem este tipo de sistema e estou mais do que feliz com o desempenho.