Bem, primeiro, é praticamente impossível solucionar problemas de VoIP (ou de voz, etc.) chamar problemas de qualidade se o cliente não estiver em sua rede: no segundo em que os pacotes saíram, você perdeu todo o controle significativo e Não tenho ideia de que tipo de largura de banda está disponível ou como a modelagem de tráfego está sendo aplicada na rede externa.
Há coisas que você pode fazer, mas que estão fora do escopo desta pergunta - Pergunte a uma nova e informe-nos o que você já fez com a solução de problemas, quais softphones / outros softwares estão usando, etc. pode te dar algumas idéias.
Quanto à negociação automática, acredito que as práticas recomendadas nos dias de hoje são ter todas as portas configuradas para negociação automática e desativá-las somente para portas / sistemas específicos se a negociação automática falhar por algum motivo. Houve alguma discussão sobre isso 2-3 anos atrás aqui mesmo na falha do servidor , mas mesmo assim o pessoal anti-legalização parecia estar no campo FUD "Porque costumava não funcionar" - o consenso geral parecia ser "Ativar a autonegociação e consertar qualquer coisa que impede que ele funcione ".
Você só teria um problema em outros locais se a máquina do cliente (laptop) estiver configurada para uma configuração específica de velocidade / duplex (que pode ou não ser o caso), mas se eles estiverem codificando o switch provavelmente está fazendo isso para o laptop também. Seria difícil julgar o impacto disso sem testes empíricos (em vários locais remotos), mas provavelmente não seria uma boa coisa se você estivesse conectado a uma porta incompatível.