Se tudo que você tem é cPanel acesso ao seu servidor, então você terá que entrar em contato com o suporte técnico da sua empresa de hospedagem para ajudá-lo a configurar isso.
Você pode usar a extensão php5 mssql para falar com o Sql Server através de uma máquina linux, mas você precisa instalar o link no servidor primeiro.
link oferece uma boa visão geral detalhada do que é necessário para instalar a extensão mssql, uma vez que os freetds está instalado. Mas isso requer acesso shell ao servidor e, normalmente, acesso sudo ou root.