Atualmente, a plataforma Ubuntu Touch não permite que os aplicativos sejam executados em segundo plano, ou enquanto a tela está desligada ... essa é uma limitação conhecida da plataforma que será abordada em algum momento (desculpe, não sei mais detalhes, talvez procure o launchpad para um bug ou registre um para que possa ser rastreado).
Como última solução alternativa, você pode instalar um aplicativo "Active Screen" para impedir que a tela seja desligada.