Uma maneira seria criar um usuário de modelo, usar edquota para definir a cota do usuário desse modelo. Então use repquota -p template_user -u real_user /filesystem
.
Algo parecido com isso pode funcionar para você.
cat /etc/passwd | cut -d: -f 1 | grep ^prefix | \
xargs -I{} -n 1 setquota -p template_user -u {} /filesystem
Você pode criar um arquivo com a lista dos usuários e as configurações para poder usar a opção --batch. Crie um arquivo que pareça
user1 block-softlimit block-hardlimit inode-softlimit inode-hardlimit
user2 block-softlimit block-hardlimit inode-softlimit inode-hardlimit
user4 block-softlimit block-hardlimit inode-softlimit inode-hardlimit
user5 block-softlimit block-hardlimit inode-softlimit inode-hardlimit
user5 block-softlimit block-hardlimit inode-softlimit inode-hardlimit
Em seguida, use um comando como cat above_file | setquota--batch /filesystem
Existem várias maneiras diferentes de você editar um script rápido, basta marcar a página de manual do setquota .