Eu posso responder minha própria pergunta agora.
A resposta é que eu escolhi a opção padrão no instalador, e quando ele me perguntou em qual disco eu queria instalar o Ubuntu, eu escolhi o segundo disco rígido de 8GB.
O PC inicializa bem no segundo disco rígido e há cerca de 2GB livres.
O primeiro disco rígido de 4GB aparece em 'Dispositivos', e eu tenho formatado isso para que eu possa usá-lo para armazenar dados.