Direto dos proftpd
docs :
Question: If virtual users are not defined in the system /etc/passwd file, then where are they defined?
Answer: There are several other locations where user information can be stored, e.g. AuthUserFiles, LDAP directories, SQL databases, and RADIUS servers. Note that virtual users are not defined in the proftpd.conf file directly.
Então a resposta é "Depende". Você precisará examinar seu arquivo /etc/proftpd.conf
para determinar quais métodos estão em uso.