Seu servidor A ainda precisa analisar o pedido, testá-lo com as regras do .htaccess e enviar a resposta de redirecionamento. No entanto, em comparação com a execução de um hit no código do seu website, presumo que isso tenha um impacto muito menor.
Além disso, se o redirecionamento para o subdomínio é feito via 302/303, todos os acessos subseqüentes do mesmo usuário irão para o servidor B imediatamente, então cada novo usuário criaria apenas um único hit para o servidor A, que deveria ser insignificante.