sobrecarga de disco. Que simples. Média comprimento da fila 50 - marque "segundos por IO / Leitura / gravação" - que também será muito alto.
Parece que basicamente você sobrecarrega totalmente os discos, e ter o modo cache de disco rígido desligado também não ajuda (configuração ruim - pelo menos colocá-lo no cache de leitura ... melhor gravação + ups - sem cache SATA NCQ não pode funcionar, matando seu desempenho).
O principal problema é o seu RAID 5 - basicamente tem tudo isso. Área de arquivo E sistema operacional, portanto, uma sobrecarga sobrecarrega todo o sistema.
Para servidores reais eu uso o WD Scorpio Black em um Raid 10 (4 discos) para o sistema operacional e (só faço virtual) virtualization root - o Raid 10 me oferece melhor desempenho. Para um servidor de arquivos de alto desempenho, eu adicionaria um segundo ataque (pode ser o RAID 5) para os arquivos. O truque aqui é que a área de arquivos e a área do sistema operacional nunca podem se sobrepor (mesmos discos). No seu caso - pegue um pequeno disco rígido (80gb ou mais) - dois deles - e coloque um espelho neles e mova o sistema operacional para ele. Então, o servidor ainda pode ser usado quando o pedido de inserção estiver acumulando.
Páginas / segundo não dizem nada - isso significa que há alguma memória virtual por aí. Se isso atingir os discos durante a cópia do arquivo (provavelmente, mas esse é outro contador de desempenho que marca a atividade física como resultado de falhas de página), então, naturalmente, ele entra na fila.
E, por favor, faça o cache. O LSI pode lhe vender algum bbu (unidade de reserva de bateria?). Eu uso o Adaptec como controlador RAID, e desde que eu tenho uma BBU neles, eu coloco o cache em write back (NÃO escreve) - o ganho de desempenho das otimizações é significativo.