Se todos os seus bancos de dados estiverem no formato InnoDB, você não precisará fazer isso. O InnoDB irá automaticamente tornar seus dados consistentes na inicialização se você fizer uma restauração.
Basicamente, o que eu estou procurando é uma maneira de dizer ao mysql (percona-flavored) para seguir os seguintes passos:
Uma solução que permite que as instruções DDL interrompam o backup é aceitável (porque essa solução de backup será aplicada com frequência e as instruções DDL serão muito raras - o pior cenário seria reverter um banco de dados uma hora a mais do que o esperado) .
As operações de backup devem ser minimamente prejudiciais ao desempenho, mas isso não é um sistema sob carga pesada. As soluções que realizam este procedimento por banco de dados ou por todo o sistema são boas, embora o último seja um pouco preferido.
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