Você certamente perderá e precisará recriar seus compartilhamentos , mas os dados em seu CSV não devem ser afetados.
O CSVFS é (na maioria das vezes) um sistema de arquivos regular (NTFS) com uma pilha de drivers de sistema de arquivos diferente (veja link para mais informações), removê-lo da lista de volumes compartilhados do cluster e adicionar ao armazenamento disponível não afetará os arquivos e dados armazenados nele.