Descobriu-se que o mysql não era o culpado. No php-fpm request_slowlog_timeout foi definido como 1s. Aumentar esse valor corrigiu os erros. Parece que o fpm estava matando processos porque o timeout aumentou 1 segundo.
Desde alguns dias, dois de nossos aplicativos php (symfony2) estão relatando os seguintes erros no mysql-logs:
[Warning] Aborted connection 253 to db: '$appname' user: '$appname' host: 'localhost' (Got an error writing communication packets)
Uma ou duas páginas não são renderizadas e retornam um erro 503 em branco, o resto do site funciona bem.
A parte estranha é que esse problema começou em um servidor há alguns dias e, hoje de manhã, um segundo servidor é afetado. O Mysql está rodando local em cada servidor e está configurado para usar soquetes unix
Qual poderia ser a causa disso? Nenhuma alteração de configuração no código ou nos aplicativos da Web foi feita.
Coisas que tentei: