Se você puder pagar (tempo de inatividade e espaço em disco temporário), criar novos dados ext4 e copiar seria muito melhor.
Alguns dos recursos do ext4 podem ser habilitados apenas no formato (por exemplo, flex_bg, suporte para > 16TiB), mas ainda mais do que isso, somente novos arquivos serão criados usando extensões muito mais eficientes (em oposição à lista de blocos indireta, dupla indireta e tripla indireta). Além disso, o ext4 tem uma alocação mais eficiente de espaço em disco (o que impacta o desempenho), então, com um novo sistema de arquivos, você obterá ganhos também. Sem mencionar que formatar / copiar também desfragmentará seus sistemas de arquivos antigos de graça.
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