Eu recomendaria não usar logs de tabela, pois eles têm um impacto não insignificante no desempenho do sistema. Isso ocorre porque o MySQL irá gravar nas tabelas de log para cada consulta e o impacto no desempenho será maior se seu banco de dados estiver mais ocupado, exatamente o oposto do que você normalmente deseja.
Não deve ser muito difícil ler os arquivos em uma janela de terminal.
Se você realmente quiser usar o Workbench para isso, consulte a documentação ( atualizado link ) e tente segui-lo e se você tiver um problema com isso, volte com uma pergunta específica.