Você pode fazer com kernels recentes, não há diferença significativa na eficiência.
Pessoalmente acho a idéia de colocar uma interface VLAN em um vínculo para ser estranho, se você quer alta disponibilidade, então certamente você a quer para toda a interface física e depois classifica VLAN mais tarde, mas pessoas suficientes pediram para que uma coisa agora.