Eu tive esse tipo de experiência com CPUs Nehalem e Westmere em servidores HP ProLiant. No meu caso, o servidor seria POST corretamente e reconheceria toda a RAM, mas geraria exceções de verificação de máquina vinculadas a um slot específico após a aplicação da carga ser aplicada.
Se ainda não o fez, tente isolar o problema em um determinado slot DIMM ou DIMM para ver se ele segue ao movimento do módulo. Se o erro persistir e estiver vinculado a um slot específico ... sugiro examinar o soquete da CPU. Verifique o soquete da placa-mãe da (s) CPU (s) e anote os pinos tortos.
Este é o equipamento da SuperMicro, então não conheço os termos da garantia. Mas esperamos que isso seja apenas RAM, já que é uma substituição mais fácil do que uma placa de sistema.