Algumas opções de IPv4 do kernel também se aplicam ao IPv6. Do último estável kernel sources , vemos que o intervalo TIME_WAIT já está definido para 60 segundos:
#define TCP_TIMEWAIT_LEN (60*HZ) /* how long to wait to destroy TIME-WAIT
* state, about 60 seconds */
Nos sistemas operacionais Linux, essa opção não é configurável. Por favor, verifique a seguinte discussão para mais detalhes.
Também recomendo ler o artigo para obter algum entendimento de como configurar o TCP TIME_WAIT corretamente.