Menu: Editar - > Preferências de perfil
Eu quero aumentar ou diminuir a transparência do gnome-terminal no Unity.
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Você tentou no Terminal - Editar - > Perfis - > Editar - > Antecedentes?
Por outro lado, você pode experimentar o CompizConfig. Quando você iniciar, vá para "Acessibilidade" e ative o plugin "Brilho, Opacidade e Saturação". Ao abri-lo na guia Opacidade, você pode definir a combinação de botões do mouse ou teclas do teclado para alterar a opacidade de qualquer janela ativa (focalizada). Padrão no meu caso foi "Alt" + roda de rolagem. Isso está funcionando perfeitamente para mim. Normalmente eu não tenho nenhum conjunto de opacidade, mas quando eu preciso, basta pressionar "Alt" e, com um pergaminho, ajustar a opacidade ao meu desejo. Espero que isso ajude.