Usando o CDO e o VBScript, você pode interagir com uma determinada caixa de correio do Exchange, desde que tenha permissões para isso. Por exemplo, eu tenho um script que varre uma determinada caixa de correio para mensagens com um determinado critério e, em seguida, executa uma ação (executar um programa, enviar um alerta, etc.). Você não precisa do Outlook instalado, apenas das DLLs relevantes, que parecem ser instaladas com o Exchange System Manager.
Alguns links úteis: link e link .
Essencialmente, você cria uma sessão MAPI, faz logon e interage com a caixa de correio. Por exemplo, eu enumero os objetos de mensagem na caixa de entrada, examino o assunto e o endereço de endereço e, em seguida, saio de lá.