Você quer dizer zoneamento FC? Se sim, então é basicamente algo parecido com uma VLAN, pois permite limitar as conexões entre os dispositivos.
Com apenas uma grande zona, essencialmente, todos os pontos podem falar com todos os outros pontos, isso soa bem, especialmente quando você tem um switch adequado que ajudará no gerenciamento de largura de banda (costumava haver hubs FC bitd, mostrando minha idade lá) muitas vezes é bom / requer que você tenha mais controle.
Por exemplo, em nosso ambiente, inteiramente baseado em Cisco, devo dizer que tudo está muito firmemente amarrado por definição. Assim, por exemplo, qualquer porta HBA pode apenas falar com as portas com as quais é projetada para falar em nossos arrays - e nada mais. Sim, é mais difícil, mas na vida, isso significa que podemos solucionar problemas com mais facilidade, e nossa segurança nazistas o ama e nunca nos joga nada de volta.
Então tudo se resume a facilidade versus controle.