Não tenho certeza de que há uma resposta para isso ao usar um mouse. Se você quisesse uma forma de linha de comando para fazer isso, você pode apenas fazer o eco do comando e canalizar essa saída para o clipe:
echo coisas que você queria copiar para a área de transferência | clipe
FYI, o clipe está disponível no Windows 2003. Acredito que seja um recurso interno.