Você pode usar o cron para agendar a chamada do seu script, mas o cron só pode executar um script a cada minuto. Não pode ser mais rápido do que isso, então provavelmente não é rápido o suficiente para o seu uso.
Parece uma péssima ideia rodar a cada poucos milissegundos, mas se é isso que você realmente quer, pode executar o script abaixo em segundo plano:
while true; do
/path/to/your/script.sh
sleep 0.01
done