O espaço de swap de uma partição de swap não usa nenhum inodes, já que as partições de swap não contêm um sistema de arquivos real.
Se você usar o (s) arquivo (s) de troca, em vez de uma partição de troca, seus sistemas usarão apenas tantos inodes quantos os arquivos de troca.
Veja por exemplo este Q & A para descobrir que parte do seu sistema de arquivos tem (também) muitos inodes para investigar a causa. (Spool de correio em fuga, arquivos de sessões PHP que não são limpos etc.