se tiver ssh, você sempre pode ssh a máquina remota e executar o seguinte comando para baixar um arquivo diretamente para aquela máquina
wget <link_of_file_to_download>
por exemplo, para baixar uma imagem do tux cujo link eu conheço em um servidor meu, eu faria os seguintes comandos
ssh user@myserver
wget http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/3/35/Tux.svg/170px-Tux.svg.png