É difícil dizer com certeza com base nas informações que você forneceu, mas duvido que a desativação e a ativação do arquivo e da impressão tenham acabado com o seu servidor. Eu acho que é muito mais provável que o servidor já tenha problemas (disco rígido ruim?) E as reinicializações terminaram.
O seu fornecedor de hardware provavelmente tem diagnósticos que lhe permitirão verificar os discos rígidos / RAID. Esse deve ser o primeiro lugar que você olha. Corrija quaisquer erros antes de prosseguir.
Como você disse nos comentários acima que seus backups são antigos (ai), supondo que seus testes de armazenamento sejam limpos e / ou o RAID seja reparado, você provavelmente terá que tentar uma instalação de reparo do Windows e esperar pelo melhor. (Se é um único disco, bem. Ouch.)
Depois que você fizer o backup do seu servidor, implemente uma estratégia de backup. Faça isso para o seu futuro, porque o hardware falha e será uma próxima vez.