Você precisa excluir arquivos desnecessários.
O bom começo é -x
-x, --one-file-system don't cross filesystem boundaries
(do man rsync (1)). Isso exclui sistemas de arquivos que você não especificou explicitamente. Lembre-se de que você precisa listar todos os pontos de montagem que deseja incluir. mount
dá lista para você.
Outra opção útil é --exclude
:
--exclude=PATTERN exclude files matching PATTERN
--exclude-from=FILE read exclude patterns from FILE
Seu comando seria algo como
rsync -avzx --exclude=/tmp --exclude=/var/cache -e "$SSH -i $KEY" $RUSER@$RHOST:$RPATH $LPATH