O Gerenciador de configuração de dispositivos só sai e faz com que o windows atualize todas as noites para ver se algum dispositivo instalado e configurado para usar a data de atualização do Windows atualiza os drivers.
Como este é um servidor interno, provavelmente não há muitos dispositivos conectados a ele, cujos drivers são atualizados com frequência. Não importa muito para desativá-lo, desde que você tenha os drivers atualizados.
Eu ficaria um pouco preocupado por não poder se conectar ao WSUS; o WSUS também deve desativar as atualizações de hardware se você disser. Talvez se o WSUS for uma versão anterior a 2012, o serviço DriverSetupManager não funcionará bem.