É uma jogada segura. Desligue o dameon do mysql e copie o diretório do banco de dados para outro disco (não importa a topologia de armazenamento), então você deve modificar a configuração do mysql, reiniciar o daemon do mysql e ir ao vivo. Este é um backup / migração bruto e é a maneira mais segura de obter um instantâneo do seu banco de dados.
Para sua segurança, você pode fazer um dump de dados para seus bancos de dados usando o mysqldump.