Eu encontrei a causa do problema. Houve um arquivo de bloqueio residual da primeira vez que o Kile não fechou corretamente (há muito tempo, provavelmente). Espero que isso possa ajudar alguém a passar pelo mesmo.
A solução para o meu problema foi apenas apagar o arquivo "myproject.kilepr.lock" (meu arquivo de projeto é chamado "myproject.kilepr"). Tudo funciona bem agora: -)