Um alias contém duas informações: um identificador exclusivo do arquivo ao qual ele é vinculado e o caminho e o nome do arquivo ao qual ele está vinculado.
Se você renomear ou mover um arquivo e, em seguida, criar um novo arquivo com o caminho e o nome do arquivo que o arquivo tinha originalmente, qualquer alias vinculado ao arquivo original agora será vinculado ao novo arquivo.
No entanto, se você renomear ou mover um arquivo sem substituí-lo e invocar um alias, o alias será atualizado para apontar para o novo caminho e nome de arquivo, fazendo uso do identificador exclusivo para fazer isso.
Um link simbólico, por outro lado, não contém um identificador único para um arquivo, e parecerá quebrado se o arquivo for renomeado ou movido e não for substituído por um arquivo do mesmo caminho e nome de arquivo.
A sua escolha deve depender do cenário que melhor lhe convier.