UPDATE
Encontrou uma integração com o indicador de aplicativos na parte inferior da tela com instruções em link
A integração do shell do Gnome ainda está faltando no Hamtster
há 1 outro projeto trabalhando nisso no github que parece ser um pouco mais avançado do que o pacote oficial
link
Para atualizações oficiais, você sempre pode seguir o blog oficial em link
Então, infelizmente, ainda não há uma integração limpa - descobri que executar o programa como um stand alone funciona muito bem - o local padrão é
/usr/bin/hamster-time-tracker
Pressione Alt + F2 e cole essa linha - deve aparecer como uma janela independente