Eu ainda observaria as configurações do host do vSphere como uma causa potencial. Qual é a data e a hora nesses servidores?
Já tentou configurá-los para sincronizar com o PDC por algum tempo e depois permitir que as VMs sincronizem com o host?
Além disso, o que acontece quando você executa w32tm /resync
? O seu servidor extrai a hora correta do PDC? Deve haver uma entrada de log de eventos informando com qual servidor ela foi sincronizada.