Não é realmente eficaz ter árbitros na mesma máquina que seus processos de mongod. Você tem um terceiro servidor não relacionado para executar o Arbiter?
(Documentado aqui: link )
A execução de vários processos mongod no mesmo servidor causará problemas de desempenho. Além disso, ter dois processos mongod utilizáveis e um árbitro na mesma máquina significa que, se os dois servidores físicos ficarem desconectados uns dos outros, cada um deles elegerá uma Primária local.