Eu provavelmente escreveria um arquivo de conclusão no servidor central que inclua a data e o nome do host; você poderia usar isso:
#!/bin/bash
# when each backup completes, write a completion file:
ssh user@central-server "touch /path/to/completion-files/$HOST-$(date +%F).complete"
E no servidor central:
#!/bin/bash
# on the central server, run this before attempting folder rotation
for h in (list of hosts); do
if [[ -e "/path/to/completion-files/$h-$(date +%F)" ]];
then # do your thing
fi
done