Parece que o Ubuntu Software Center faz coisas diferentes para aplicativos com entradas de área de trabalho (item de menu e ícone) e aqueles sem.
Portanto, o comportamento que você está vendo para o seu pacote é o padrão pretendido para pacotes que não possuem entradas na área de trabalho, tiradas do arquivo de controle: Title é a descrição curta, subtítulo é o nome do pacote.
Para pacotes com uma entrada na área de trabalho, ele é retirado do arquivo .desktop: Título é a entrada "Nome:" e a legenda é a entrada "Comentário:".