Os links da Warner são exatamente o que você precisa. Embora eles devam ser sua referência abrangente, eles podem ser um pouco secos para uma introdução ao conceito de mod_auth_ *. Tente procurar por "apache htpasswd" ou algo parecido. Aqui está um tutorial decente para você começar:
Nota: Funciona da mesma forma para subdomínios como para subdiretórios.