As configurações que você deseja alterar são apenas do lado do cliente, infelizmente. Ao contrário, digamos, do OpenVPN, em que você "envia" informações de configuração do servidor VPN para o cliente, no cliente Microsoft VPN, a opção "Usar gateway padrão na rede remota" é definida apenas no cliente.
O Kit de Administração do Connection Manager (CMAK) permitirá que você crie um EXE que pode ser executado em clientes para configurar a conexão VPN com todos os parâmetros desejados.
Alguma frustração pode vir do infeliz método pelo qual o cliente recebe uma rota para a rede remota. Quando a opção "Usar gateway padrão na rede remota" está desabilitada, o cliente recebe uma rota para a rede remota com base no endereço IP "classful" do servidor VPN (isso muda no Windows 7, mas não tenho detalhes de a mudança acessível). Se você está apenas fazendo uma VPN em um pequeno "/ 24" rede numerada "192.168.x.x", então isso vai funcionar bem.
Se você tem uma topologia mais complexa, no entanto, isso lhe dará ajustes. É suposto que o CMAK forneça uma maneira de executar um script no cliente depois que a VPN aparece e modificar a tabela de roteamento do cliente, mas nunca consegui que essa funcionalidade funcionasse em computadores cliente baseados no Windows XP SP2. Eu adoraria ouvir de alguém que tenha.