Eu acredito que será necessário pelo menos ter um administrador de domínio no servidor LDAP vindo para digitar sua senha pelo menos uma vez para realizar o que você quer e juntar o Samba ao domínio.
Dado que, as etapas devem ser relativamente simples. Extraído do Samba Wiki , defina o seguinte na configuração do seu samba:
* passdb backend = ldapsam:ldap://<your-hostname>
* ldap suffix =
* ldap admin dn
Em seguida, execute smbpasswd -w para que o samba saiba a senha do admin dn.
Há também um bom writeup aqui .