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O sistema não é necessário para backups. Contas com o privilégio "Backup de arquivos e diretórios" podem ignorar a segurança do sistema de arquivos.
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O Proprietário do criador costuma ser usado para conceder permissões específicas aos usuários que criam arquivos. Por exemplo, se você tiver um diretório que permita aos usuários criar arquivos, mas não modificar ou excluir, você poderá usar o Proprietário do Criador para conferir a permissão Modificar aos arquivos das pessoas que os criaram. Se você não precisar disso ou se for difícil para os usuários entenderem, provavelmente você não deve usá-lo.
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Geralmente, gerencio todas as permissões usando o NTFS e defino a permissão de compartilhamento para controle total. A exceção seria se você quiser tornar o compartilhamento mais restritivo, como somente leitura.