Você só precisa configurar o Apache na porta 80, que é o padrão. E você precisa do IIS para ligar à porta 8080 (ou qualquer porta que você queira). Por padrão, o IIS será vinculado à porta 80, mas você pode editar o número da porta nas propriedades de cada site. Este artigo trata da alteração da porta que o IIS escuta - link . Dessa forma você pode ter ambos funcionando em vez de ter que parar um antes de iniciar o outro.