Parece que você está correndo para o "recurso" do yum em sistemas x86_64, onde yum install foo
tenta instalar foo.i386
também. Experimente
[root@x171 ~]# yum -y install mysql-libs.x86_64 php.x86_64 php-gd.x86_64 gd.x86_64 mysql.x86_64 mysql-server.x86_64 mysql-devel.x86_64 mod_auth_mysql.x86_64 php-mysql.x86_64 php-common.x86_64